Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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