Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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