Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms