Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21060J3KMU4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21060J3KMU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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