Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm10477F6SW83 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm10477F6SW83 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm10477F6SW83 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10477F6SW83 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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