Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms