Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp944E9PUS4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms