Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms