Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-M5A7VMS3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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