Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3173A6NAS3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms