Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms