Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd2Q9Z2E1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd2Q9Z2E1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms