Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nme3Q9WV85 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms