Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms