Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChmQ9QXG2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms