Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms