Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc38a3Q9DCP2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms