Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1mQ9DAD9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1mQ9DAD9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms