Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx5Q9D8U8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms