Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ribc2Q9D4Q1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ribc2Q9D4Q1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms