Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx17Q9D0I4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx17Q9D0I4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms