Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NmbQ9CR53 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms