Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn2Q9CQS6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms