Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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