Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rpl39lQ9CQD0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl39lQ9CQD0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rpl39lQ9CQD0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rpl39lQ9CQD0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rpl39lQ9CQD0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl39lQ9CQD0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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