Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxc12Q8K5B8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc12Q8K5B8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxc12Q8K5B8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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