Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwc2Q8C8N3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms