Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dclre1bQ8C7W7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms