Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pggt1bQ8BUY9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pggt1bQ8BUY9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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