Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms