Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms