Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms