Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn13Q3UW68 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn13Q3UW68 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms