Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr1d1Q3UV55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms