Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms