Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip13Q3UA06 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms