Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serac1Q3U213 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serac1Q3U213 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms