Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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