Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tamm41Q3TUH1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tamm41Q3TUH1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tamm41Q3TUH1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms