Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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