Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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