Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spatc1Q148B6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Spatc1Q148B6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Spatc1Q148B6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spatc1Q148B6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spatc1Q148B6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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