Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NeblQ0II04 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms