Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atf4Q06507 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms