Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms