Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms