Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx1P81068 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms