Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx3P81067 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms