Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx4P70452 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms