Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P58686 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P58686 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P58686 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P58686 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P58686 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P58686 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P58686 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms